Les consoles de chez Sega ont ellles aussi eu droits à quelques titres Megaman, la Game Gear a eu un titre exclusif sorte de mix de plusieurs épisodes NES et la Megadrive a eu une compilation des 3 premiers épisodes de la série, sortis à l'époque sur NES.

Cette version se voit affublée de meilleurs graphismes et d'une partie sonore revue, mais par contre Capcom aurait pû faire mieux niveau animation, celle-ci souffrant de ralentissements, alors que la Megadrive est plutôt douée niveau gestion de sprites.